Anstatt sich zu ergeben, entschieden sich die kretischen Rebellen und die verbliebenen Mönche im Kloster, sich in der Schießpulverkammer des Klosters in die Luft zu sprengen, wodurch sie sich selbst und viele osmanische Truppen töteten. Diese Opfergabe gilt als wichtiges Symbol für kretische Unabhängigkeit und Widerstand.
Das genaue Baujahr des Kloster Arkadi ist nicht genau zu beziffern. Es ist jedoch bekannt, dass das Kloster auf einem älteren byzantinischen Kloster errichtet wurde, das wahrscheinlich im 5. oder 6. Jahrhundert n. Chr. gegründet wurde. Die ältesten Überreste, die im Kloster gefunden wurden, stammen aus dieser Zeitperiode. Im Laufe der Jahrhunderte wurde das Kloster mehrmals zerstört und wieder aufgebaut, wobei seine heutige Form größtenteils aus der osmanischen Zeit und dem 16. Jahrhundert stammt.
Heute ist das Kloster Arkadi ein beliebtes Touristenziel und ein funktionierendes Kloster. Besucher können die historischen Gebäude besichtigen und Artefakte und Reliquien aus der Geschichte des Klosters betrachten.
Das Kloster ist in der Regel zwischen 9 und 19 Uhr geöffnet, der Eintrittspreis für Erwachsene beträgt drei Euro (Stand Sommer 2023, ohne Gewähr).
